cellxgenedp

DOI:10.18129 / B9.bioc.cellxgenedp

在cellxgene数据门户中发现和访问单细胞数据集

Bioconductor版本:发行版(3.15)

cellxgene数据门户(https://cellxgene.cziscience.com/)为以标准方式处理的单细胞序列数据集合提供了一个图形用户界面，以“计数矩阵”摘要。cellxgenedp包提供了一个可选的、基于r的接口，允许数据发现、查看和下载。

作者:Martin Morgan [aut, cre]， Kayla Interdonato [aut]， Daniel Parker [aut, cph] (jsoncons c++库创建者)

维护人员:Martin Morgan

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("cellxgenedp")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“cellxgenedp”)

超文本标记语言	R脚本	发现和下载数据集和文件从cellxgene数据门户
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DataImport，SingleCell，软件，ThirdPartyClient
版本	1.0.1
Bioconductor自	BioC 3.15 (R-4.2)(0.5年)
许可证	BSL-1.0 |文件许可证
取决于
进口	dplyr，httr，旋度，jsonlite， utils, tools, parallel，闪亮的，DT
链接	cpp11
建议	zellkonverter，SingleCellExperiment，HDF5Array，BiocStyle，knitr，rmarkdown，testthat(> = 3.0.0),嘲笑
SystemRequirements	c++ 14
增强了
URL
取决于我
进口我	UniProt.ws
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	cellxgenedp_1.0.1.tar.gz
Windows二进制	cellxgenedp_1.0.1.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	cellxgenedp_1.0.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cellxgenedp
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ cellxgenedp
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/cellxgenedp/
包下载报告	下载数据
bioc3.15的旧源包	源存档