Bioconductor版本:版本(3.16)
这个包实现四个主要亚型分类器为高档浆液性卵巢癌(硫化汞)所描述的Helland et al。(PLoS One, 2011), Bentink et al。(PLoS One, 2012), Verhaak et al。(中国投资,2013),和Konecny et al。(中华肿瘤杂志,2014)。此外,包分类器实现了一个共识,巩固和提高在该亚型分类器的鲁棒性,从而提供可靠的硫化汞卵巢肿瘤患者分层明确定义的子类型。
作者:陈Gregory M, Lavanya Kannan,路德维希Geistlinger, Victor Kofia李维Waldron本杰明Haibe-Kains
维护人员:本杰明Haibe-Kains < benjamin.haibe。实物地租在utoronto.ca >
从内部引用(R,回车引用(“consensusOV”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“consensusOV”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“consensusOV”)
HTML | R脚本 | 卵巢癌的分子亚型 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 分类,聚类,DifferentialExpression,GeneExpression,微阵列,软件,转录组 |
版本 | 1.20.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.6 (r - 3.4)(5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (> = 3.6) |
进口 | Biobase,GSVA,gdata,genefu,limma,matrixStats,randomForest统计,跑龙套的方法 |
链接 | |
建议 | BiocStyle,ggplot2,knitr,rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://www.pmgenomics.ca/bhklab/software/consensusOV |
BugReports | https://github.com/bhklab/consensusOV/issues |
取决于我 | |
进口我 | signifinder |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
源包 | consensusOV_1.20.0.tar.gz |
Windows二进制 | consensusOV_1.20.0.zip |
macOS二进制(x86_64) | consensusOV_1.20.0.tgz |
macOS二进制(arm64) | consensusOV_1.20.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/consensusOV |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ consensusOV |
Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/consensusOV/ |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/consensusOV/ |
包下载报告 | 下载数据 |
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