csdR

DOI:10.18129 / B9.bioc.csdR

差异基因共表达

Bioconductor版本:Release (3.15)

这个包包含在两种不同条件下运行差异基因共表达的功能。该算法受到Voigt等人2017年的启发，发现了保守的、特定的和分化的基因(因此命名为CSD)。该软件包包括有效和方差计算自举和Welford算法。

作者:Jakob Peder Pettersen [aut, cre]

维护者:Jakob Peder Pettersen 上写道

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“csdR”)

超文本标记语言	R脚本	csdR
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression，GeneExpression，GraphAndNetwork，网络，软件
版本	1.2.0
在Bioconductor	bio3.14 (R-4.1)(1年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 4.1.0)
进口	WGCNA，胶水，RhpcBLASctl，matrixStats，Rcpp
链接	Rcpp
建议	rmarkdown，knitr，testthat(> = 3.0.0),BiocStyle，magrittr，igraph，dplyr
SystemRequirements
增强了
URL	https://almaaslab.github.io/csdRhttps://github.com/AlmaasLab/csdR
BugReports	https://github.com/AlmaasLab/csdR/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	csdR_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	csdR_1.2.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64)	csdR_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/csdR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/csdR
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/csdR/
软件包下载报告	下载数据