cytoMEM

DOI:10.18129 / B9.bioc.cytoMEM

标记富集建模(MEM)

Bioconductor版本:Release (3.15)

MEM，标记富集建模，自动生成和显示定量标签的细胞群体已从单细胞数据识别。MEM的输入是一个数据集，该数据集具有预聚或预门控的群体，行中有单元格，列中有特征。标签传达了测量特征的列表以及特征在每个种群上的相对富集水平。MEM可以应用于各种各样的数据类型，并可以比较来自流式细胞术、海量细胞术、单细胞RNA-seq和使用RMSD的光谱流式细胞术的MEM标签。

作者:Sierra Lima [aut]，柯尔斯顿·迪金斯[作者]，乔纳森·爱尔兰语[aut, cre]

维护者:Jonathan Irish < Jonathan。访问vanderbilt。edu>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“cytoMEM”)

超文本标记语言	R脚本	Intro_to_Marker_Enrichment_Modeling_Analysis
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CellBiology，分类，聚类，DataImport，DataRepresentation，FlowCytometry，蛋白质组学，SingleCell，软件，SystemsBiology
版本	1.0.0
在Bioconductor	BioC 3.15 (R-4.2)(0.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 4.2.0)
进口	gplots、工具、flowCore， grDevices, stats, utils，matrixStats、方法
链接
建议	knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/cytolab/cytoMEM
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	cytoMEM_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	cytoMEM_1.0.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	cytoMEM_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cytoMEM
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/巨细胞
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/cytoMEM/
软件包下载报告	下载数据