ancombc

doi:10.18129/b9.bioc.ancombc

这是发展ANCOMBC的版本;对于稳定版本,请参阅ancombc

分析具有偏置校正的微生物组的组成

生物导体版本:开发(3.16)

ANCOMBC是一个包装,用于使观察到的微生物数据归一化,这是由于样本之间的不平等采样分数,并鉴定出相对于感兴趣的协变量(例如,识别类群(例如,门,家族,属,物种等))(例如,研究组(例如)(例如))在两个或多个多个样品组之间。

作者:Huang Lin [CRE,AUT],Shyamal Das Peddada [aut]

维护者:pitt.edu>的Huang lin

引用(从r内,输入引用(“ ANCOMBC”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version ='devel')biocmanager :: install(“ ancombc”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ ancombc”)

html R脚本 ancombc
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 差异性,,,,微生物组,,,,正常化,,,,测序,,,,软件
版本 1.7.0
在生物导体中 Bioc 3.12(R-4.0)(1。5年)
执照 艺术2.0
要看
进口 统计,大量的,,,,nloptr,,,,rdpack,,,,门索,,,,微生物组
链接
建议 尼特,,,,平淡无奇,,,,测试,,,,DT,,,,马格里特,,,,qwraps2(> = 0.5.0),rmarkDown
系统要求
增强
URL https://github.com/frederickhuanglin/ancombc
BugReports https://github.com/frederickhuanglin/ancombc/issues
取决于我
进口我 微生物膜标志物
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 ancombc_1.7.0.0.tar.gz
Windows二进制 ancombc_1.7.0.zip
MacOS 10.13(高山脉)
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ancombc
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/ancombc
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/ancombc/
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