字母

doi:10.18129/b9.bioc.alphabeta

这是发展Alphabeta的版本;对于稳定版本,请参阅字母

来自植物中高通量DNA甲基化数据的释放速率和光谱的计算推断

生物导体版本:开发(3.16)

Alphabeta是一种计算方法,用于估计植物中高通量DNA甲基化数据的估计速率和光谱。该方法已专门设计为:1。在多代突变积累线(MA-LINES)的背景下分析“种系”的缩影。2.在植物发育和衰老的背景下分析“体细胞”的表述。

作者:Yadollah Shahryary Dizaji [Cre,Aut],Frank Johannes [aut],Rashmi Hazarika [aut]

维护者:yadollah shahryary dizaji

引用(从r内,输入引用(“ Alphabeta”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version ='devel')biocmanager :: install(“ alphabeTa”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Alphabeta”)

PDF R脚本 字母
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 表观遗传学,,,,功能基因组学,,,,遗传学,,,,数学生物学,,,,软件
版本 1.11.0
在生物导体中 Bioc 3.10(R-3.6)(2。5年)
执照 GPL-3
依靠 R(> = 3.6.0)
进口 dplyr(> = 0.7),Data.Table(> = 1.10),Stringr(> = 1.3),utils(> = 3.6.0),gtools(> = 3.8.0),Optimx(> = 2018-7.10),expm(> = 0.999-4),统计(> = 3.6),生物比较(> = 1.18),Igraph(> = 1.2.4),图形(> = 3.6),GGPLOT2(> = 3.2),grdevices(> = 3.6),情节(> = 4.9)
链接
建议 尼特,,,,rmarkDown
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 alphabeta_1.11.0.tar.gz
Windows二进制 alphabeta_1.11.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) alphabeta_1.11.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/alphabeta
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/alphabeta
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/alphabeta/
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