Anaquin

DOI:10.18129 / B9.bioc.Anaquin

这是发展Anaquin版本;稳定的发布版本,请参阅Anaquin。

亮片的统计分析

Bioconductor版本:发展(3.16)

该项目旨在支持使用亮片(合成测序激增控制)拥有并提供Garvan医学研究学院。我们的目标是为定量分析提供一个标准的开源库,造型和激增的可视化控制。

作者:Ted黄

维修工:Ted Wong < t。黄在garvan.org.au >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“Anaquin”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“Anaquin”)

PDF	R脚本	Anaquin——装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DifferentialExpression,GeneExpression,ImmunoOncology,预处理,RNASeq,软件
版本	2.21.0
Bioconductor自	BioC 3.4 (r - 3.3)(6年)
许可证	BSD_3_clause +文件许可证
取决于	R (> = 3.3),ggplot2(> = 2.2.0)
进口	ggplot2,ROCR,knitr,qvalue,locfit、方法、统计跑龙套,plyr,DESeq2
链接
建议	RUnit,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	www.sequin.xyz
BugReports	https://github.com/student-t/RAnaquin/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	Anaquin_2.21.0.tar.gz
Windows二进制	Anaquin_2.21.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	Anaquin_2.21.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Anaquin
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ Anaquin
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/Anaquin/
包下载报告	下载数据