bprmeth

doi:10.18129/b9.bioc.bprmeth

这是发展Bprmeth的版本;对于稳定版本,请参阅bprmeth

模型高阶甲基化剖面

生物导体版本:开发(3.16)

BPRMETH软件包是一种概率的方法,可以量化甲基化剖面的显式特征,这种方式将使在下游建模工作中正式使用此类曲线,例如预测基因表达水平或基因组基因组水平或细胞,根据其甲基化概况。

作者:Chantriolnt-Andreas Kapourani [AUT,CRE]

维护者:chantriolnt andreas kapourani

引用(从r内,输入引用(“ bprmeth”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version ='devel')biocmanager :: install(“ bprmeth”)的用法

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Bprmeth”)

html R脚本 BPRMETH:模型高阶甲基化轮廓
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 贝叶斯,,,,聚类,,,,覆盖范围,,,,DNAMETHYLATY,,,,表观遗传学,,,,特征提取,,,,基因表达,,,,结肠管制,,,,遗传学,,,,免疫学,,,,kegg,,,,rnaseq,,,,回归,,,,测序,,,,Singlecell,,,,软件
版本 1.23.0
在生物导体中 Bioc 3.4(R-3.3)(5。5年)
执照 GPL-3 |文件执照
要看 r(> = 3.5.0),基因组机
进口 断言, 方法,大量的,,,,多帕尔, 平行,E1071,,,,地球,,,,foreach,,,,Randomforest,统计iranges,,,,S4VECTORS,,,,Data.Table,图形,truncnorm,,,,mvtnorm,,,,RCPP(> = 0.12.14),矩阵,,,,马格里特,,,,克恩拉布,,,,GGPLOT2,,,,牛仔图,,,,生物使用
链接 RCPP,,,,rcpparmadillo
建议 测试,,,,尼特,,,,rmarkDown
系统要求
增强
URL
取决于我 梅利莎
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 bprmeth_1.23.0.tar.gz
Windows二进制 bprmeth_1.23.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) bprmeth_1.23.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bprmeth
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/bprmeth
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/bprmeth/
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