这是发展Bprmeth的版本;对于稳定版本,请参阅bprmeth。
生物导体版本:开发(3.16)
BPRMETH软件包是一种概率的方法,可以量化甲基化剖面的显式特征,这种方式将使在下游建模工作中正式使用此类曲线,例如预测基因表达水平或基因组基因组水平或细胞,根据其甲基化概况。
作者:Chantriolnt-Andreas Kapourani [AUT,CRE]
维护者:chantriolnt andreas kapourani
引用(从r内,输入引用(“ bprmeth”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version ='devel')biocmanager :: install(“ bprmeth”)的用法
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Bprmeth”)
html | R脚本 | BPRMETH:模型高阶甲基化轮廓 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | 贝叶斯,,,,聚类,,,,覆盖范围,,,,DNAMETHYLATY,,,,表观遗传学,,,,特征提取,,,,基因表达,,,,结肠管制,,,,遗传学,,,,免疫学,,,,kegg,,,,rnaseq,,,,回归,,,,测序,,,,Singlecell,,,,软件 |
版本 | 1.23.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.4(R-3.3)(5。5年) |
执照 | GPL-3 |文件执照 |
要看 | r(> = 3.5.0),基因组机 |
进口 | 断言, 方法,大量的,,,,多帕尔, 平行,E1071,,,,地球,,,,foreach,,,,Randomforest,统计iranges,,,,S4VECTORS,,,,Data.Table,图形,truncnorm,,,,mvtnorm,,,,RCPP(> = 0.12.14),矩阵,,,,马格里特,,,,克恩拉布,,,,GGPLOT2,,,,牛仔图,,,,生物使用 |
链接 | RCPP,,,,rcpparmadillo |
建议 | 测试,,,,尼特,,,,rmarkDown |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | 梅利莎 |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | bprmeth_1.23.0.tar.gz |
Windows二进制 | bprmeth_1.23.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | bprmeth_1.23.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bprmeth |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/bprmeth |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/bprmeth/ |
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