不良区域

doi：10.18129/b9.bioc.badregionfinder

这是发展BadRegionFinder的版本；对于稳定版本，请参阅不良区域。

BadRegionFinder：用于识别覆盖不良区域的R/Bioconductor套件

生物导体版本：开发（3.16）

BadRegionFinder是一个软件包，用于识别带有BAM文件的序列对齐数据的不良，可接受和良好覆盖范围的区域。可以将整个基因组和一组目标区域视为。提供各种视觉和文本类型的输出。

作者：莎拉·桑德曼

维护者：莎拉·桑德曼（Sarah Sandmann

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ badregregionfinder”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ BadRegionfinder”）

PDF	R脚本	使用BadRegionFinder
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	结盟，，，，分类，，，，覆盖范围，，，，测序，，，，软件，，，，全媒体
版本	1.25.0
在生物导体中	Bioc 3.3（R-3.3）（6。5年）
执照	LGPL-3
要看
进口	变体，，，，rsamtools，，，，Biomart，，，，基因组机，，，，S4VECTORS，utils，统计，grdevices，图形
链接
建议	bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	BADRIGIONFINDER_1.25.0.TAR.GZ
Windows二进制	BADRIGIONFINDER_1.25.0.ZIP
MacOS 10.13（高山脉）	BADRIGIONFINDER_1.25.0.TGZ
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/badregionfinder
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/badregionfinder
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/badregionfinder/
软件包下载报告	下载统计