BioNetStat

DOI:10.18129 / B9.bioc.BioNetStat

这是发展BioNetStat版本;稳定版请参见BioNetStat

生物网络分析

Bioconductor版本:开发(3.14)

一个包执行差分网络分析,差分节点分析(差分共表达分析),网络和代谢途径视图。

作者:Vinícius Jardim, Suzana Santos, André Fujita, Marcos Buckeridge

维护者:Vinicius Jardim

引文(从R内,输入引用(“BioNetStat”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("BioNetStat")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“BioNetStat”)

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细节

biocViews DifferentialExpressionGeneExpressionGeneSetEnrichmentGraphAndNetworkImmunoOncology代谢组学微阵列网络NetworkInference通路蛋白质组学RNASeq测序软件SystemsBiology
版本 1.13.0
在Bioconductor BioC 3.7 (R-3.5)(3年)
许可证 GPL (>= 3)
取决于 R (>= 4.0),闪亮的igraphshinyBSpathviewDT
进口 BiocParallelRJSONIO晶须yamlpheatmapggplot2plyr, utils,统计,RColorBrewerHmisc心理knitrrmarkdown减价
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URL http://github.com/jardimViniciusC/BioNetStat
BugReports http://github.com/jardimViniciusC/BioNetStat/issues
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包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 BioNetStat_1.13.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra) BioNetStat_1.13.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BioNetStat
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/BioNetStat
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/BioNetStat/
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