BioTIP

DOI:10.18129 / B9.bioc.BioTIP

这是发展BioTIP版本;稳定的发布版本,请参阅BioTIP。

BioTIP: R包的描述生物转折点

Bioconductor版本:发展(3.17)

采用转录组概要文件的转折点论解开疾病管理轨道。

作者:安德鲁•戈尔茨坦Zhezhen Wang玉溪太阳,Biniam Feleke, Qier,安东尼奥·菲新安杨

维修工:玉溪(Jennifer)太阳< ysun11 uchicago.edu >, Zhezhen王< Zhezhen uchicago.edu >,杨和X冬青< xyang2 uchicago.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“BioTIP”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“BioTIP”)

HTML	R脚本	BioTIP - R包描述生物转折点
PDF		参考手册

细节

biocViews	GeneExpression,RNASeq,测序,软件,转录
版本	1.13.0
Bioconductor自	BioC 3.10 (r - 3.6)(3年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.6)
进口	igraph,集群,心理,stringr,GenomicRanges,质量,食物
链接
建议	knitr,减价基地,rmarkdown,ggplot2
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/xyang2uchicago/BioTIP
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	BioTIP_1.13.0.tar.gz
Windows二进制	BioTIP_1.13.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	BioTIP_1.13.0.tgz
macOS二进制(arm64)	BioTIP_1.13.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BioTIP
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ BioTIP
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/BioTIP/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/BioTIP/
包下载报告	下载数据