BiocParallel

DOI:10.18129 / b9.bioc.biocomparall.

这是发展BiocParallel版本;稳定的发布版本请参见BiocParallel

用于平行评估的生物导体设施

生物导体版本:开发(3.13)

该包提供了用于并行评估的修改版本和新颖的功能实现,为Bioconductor对象量身定制。

作者:Bioconductor Package Maintainer [cre], Martin Morgan [aut], Valerie Obenchain [aut], Michel Lang [aut], Ryan Thompson [aut], Nitesh Turaga [aut], Aaron Lun [ctb]

Maintainer: Bioconductor Package Maintainer < Maintainer at Bioconductor。org>

引文(从R中输入引用(“BiocParallel”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用BiocManager::install(version='devel')

有关较旧版本的R,请参阅适当的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档,请启动R并输入:

BROWSEVIGNETTES(“BIOCPARILLELS”)

PDF R脚本 1.生物共序介绍
PDF R脚本 2.介绍BatchtoolsParam
PDF R脚本 3.错误、日志和调试
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 基础设施软件
版本 1.25.3
Bioconductor自 BioC 2.13 (R-3.0)(7.5年)
许可证 GPL-2 | GPL-3
取决于 方法
进口 属性,跑龙套,futile.logger平行,
链接 黑洞
建议 BiocGenerics, 工具,foreachBatchjobs.BBmisc多达齐全RmpiGenomicranges.RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14txdb.hsapiens.ucsc.hg19.knowngene.VariantAnnotationRsamtools基因管理ShortReadcodetoolsRUnit生物焦knitrBatchtools.data.table
系统要求 c++ 11
增强了
URL https://github.com/bioconductor/biocomallal.
BugReports https://github.com/Bioconductor/BiocParallel/issues
取决于我 培根BEclear红衣主教ClassifyRclusterSeqconsensusSeekeR文案德科德沃瑟Dexseq.DMCFBDMCHMMdoppelgangRDSS弗雷泽GenomicFileshiReadsProcessor检查工商管理硕士比赛metagene2ncGTWOscope先驱者PCAN季节性ddna.pRolocRqc测序ShortReadSigCheck光谱STROMA4SummarizedBenchmark股东价值分析variancePartitionxcms
进口我 abseqRADImpute粘贴ALDEx2AlphaBeta阿尔卑斯山AlpsNMRamplican亚瑟士ASpediaFIatSNPbambu强盗基础知识后面;bayNormBiocNeighborsBioCorBiocSingularBIOMMBioNetStat生物墨呢biscuiteer咆哮布伦德布BSSeq.CAGEfightR篮球选手cellbaseR蜂窝状cellmixs.censcytChIPexoQualchipqc.ChromSCapechromswitchchromVARcnvranger.CoGAPS共识contiBAITCoreGxcoseqcpvSNPCRISPRseekCrispRVariantscsawcydardasperdcGSAdebCAMDEComplexDiseasederfinderDEScan2DESeq2DEsingleDiffBinddmrseq剂量DRIMSeqDropletUtils沙丘easyRNASeqemdomic.erma.ERSSA逃避exomePeak2fgseaFindMyFriendsflowcatchRflowSpecsGDCRNAToolsGenoGAM基因管理genotypeevalgmapRgscreendGSEABenchmarkeRGSVAGUIDEseqh5vcHicbricks.HiCcompareHTSeqGenieHTSFilterIASVA.icetea理想的ihwpaper.imaInPAS兴趣离子首次公开募股ISAnalyticsivaKinSwingRLineagePulseloci2pathLowMACAMACPETmbkmeans麦克巴斯特metabomxtrmetaseqR2MethCPMETHYLAID.甲基葡萄酒methylInheritanceMETNET.MIGSAminfiMMAPPR2MOGAMUNmotifbreakRMPRAnalyzemsnbase.MSstatsSampleSizemultiHiCcomparemumosa马斯喀特NBAMSeqNBSpliceNPARCOmicsLonDAorfik.oveseg.PAIRADISEPCAtoolsPharmacoGxpipeComp婴儿车PrecisionTrialDrawer高伦雅芙挑战profileplyrqpgraphqseaQuasRRadioGxRcwl重新计票RegEnrich重新RJMCMCNucleosomesRNAmodRRsamtoolsRuvcorr.撒尿scClassifyscDblFinderscDDscdeSCFA散粒scMerge斯通司康饼scoreInvHapscPCA食物scRecover颈背scTHI天窗芝麻SEtoolssigFeaturesignatureSearchsingleCellTKsingscore斯文soGGiSpectralTADSpicyr.飞溅SplicingGraphssrnadiffTAPseqTarSeqQCTBSignatureProfilerTFBSToolsTMixClust毒素TPP2DTRADESEQ.树ummariedexperiment.特纳时髦的TSRchitectTVTBVariantFilteringVarianttools.伶盗龙waddRWeitrix.Zinbwave.
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链接给我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包 BiocParallel_1.25.3.tar.gz
Windows二进制 BiocParallel_1.25.3.zip
macOS 10.13 (High Sierra) biocparallel_1.25.3.tgz.
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BiocParallel
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ BiocParallel
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/BiocParallel/
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  • Bioc-devel邮件列表-为包开发人员2021欧洲杯体育投注开户