BloodGen3模块

doi:10.18129/b9.bioc.bloodgen3module

这是发展BloodGen3Module的版本;对于稳定版本,请参阅BloodGen3模块

此R包用于执行模块库分析和生成指纹表示

生物导体版本:开发(3.16)

BloodGen3Module软件包提供了R用户执行模块库分析和生成指纹表示的功能。功能可以通过指纹网格图或指纹热图执行组比较或单个样本分析和可视化。模块库分析通常涉及确定明显增加或减少的每个模块的本构基因的百分比。正如我们详细描述的;指纹格式,其中红色和蓝色斑点表明模块活动的增加或减少。这些斑点随后在网格上表示,每个位置被分配给给定的模块,或者在热图中,将样品排列在列中,并将模块排成行。

作者:Darawan Rinchai [AUT,CRE]

维护者:darawan rinchai

引用(从r内,输入引用(“ BloodGen3Module”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ floodgen3module”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ BloodGen3Module”)

html R脚本 BloodGen3Module:模块化库分析和可视化
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 基因表达,,,,软件,,,,可视化
版本 1.5.0
在生物导体中 Bioc 3.13(R-4.1)(1年)
执照 GPL-2
要看 R(> = 4.1)
进口 总结性特征,,,,实验室,方法,网格,图形,统计,grdevices,循环,,,,测试,,,,复杂的图像(> = 1.99.8),GGPLOT2,,,,矩阵,,,,gtools,,,,RESHAPE2,,,,预处理,,,,Randomcolor,,,,V8,,,,林玛
链接
建议 运行,,,,DevTools,,,,生物基因,,,,尼特,,,,rmarkDown
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 BloodGen3Module_1.5.0.tar.gz
Windows二进制 BloodGen3Module_1.5.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) BloodGen3Module_1.5.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bloodgen3module
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/bloodgen3Module
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/bloodgen3module/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题: