布拉替伯

doi:10.18129/b9.bioc.brainsaber

这是发展Brainsaber的版本;对于稳定版本,请参阅布拉替伯

Biobase表达套件中的大脑跨地图集

生物导体版本:开发(3.16)

艾伦脑科学研究所提供了RNA测序(RNA-SEQ)数据资源,用于研究参与人脑发育的转录机制,称为Brainspan。BrainSaber是一个R软件包,可通过为两个数据集生成动态相似性热图,从而促进用户数据与在Brainspan地图集中发现的各种发育阶段和大脑结构的比较。它还为用户数据提供了一个自验证的容器。

作者:Carrie Minette [AUT],Evgeni Radichev [AUT],USD生物医学工程[AUT,CRE]

维护者:USD生物医学工程

引用(从r内,输入引用(“ Brainsaber”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ brainsaber”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ BrainSaber”)

html R脚本 布拉替伯
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 基因表达,,,,测序,,,,软件,,,,可视化
版本 1.7.0
在生物导体中 Bioc 3.12(R-4.0)(1。5年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 4.1.0),Biomart,,,,总结性特征
进口 Data.Table,,,,LSA, 方法,S4VECTORS,utils,Biocfilecache,,,,闪亮的
链接
建议 生物使用,,,,复杂的图像,,,,快速积分,,,,热图,,,,尼特,,,,情节,,,,rmarkDown
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 brainsaber_1.7.0.tar.gz
Windows二进制 brainsaber_1.7.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) brainsaber_1.7.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/brainsaber
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/brainsaber
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/brainsaber/
软件包下载报告 下载统计

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