这是发展Bumpymatrix的版本;对于稳定版本,请参阅bumpymatrix。
生物导体版本:开发(3.16)
在矩阵的每个条目中实现bumpymatrix类和几个用于保持非量表对象的子类。这类似于破烂的阵列,但破烂的度在第三维,就像颠簸的表面 - 因此。特别令人感兴趣的是bumpydataframematrix,其中每个条目都是生物导体数据框架。这使我们能够自然地表示与二维容器(如SumparieDexperiment和MultiasSayExperiment对象)兼容的格式的多元数据。
作者:Aaron Lun [AUT,CRE],Genentech,Inc。[CPH]
维护者:aaron lun
引用(从r内,输入引用(“ bumpymatrix”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ bumpymatrix”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ bumpymatrix”)
html | R脚本 | Bumpymatrix类 |
参考手册 | ||
文本 | 执照 |
生物浏览 | datarepresentation,,,,基础设施,,,,软件 |
版本 | 1.5.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.13(R-4.1)(1年) |
执照 | 麻省理工学院 +文件执照 |
要看 | |
进口 | UTIT,方法,矩阵,,,,S4VECTORS,,,,iranges |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,测试 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | //www.andersvercelli.com/packages/bumpymatrix |
BugReports | https://github.com/ltla/bumpymatrix/issues |
取决于我 | |
进口我 | coregx,,,,MousegastrulationData |
建议我 | ggspavis,,,,Spatiaxlexperiment,,,,Stexampledata |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | bumpymatrix_1.5.0.tar.gz |
Windows二进制 | bumpymatrix_1.5.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | bumpymatrix_1.5.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bumpymatrix |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/bumpymatrix |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/bumpymatrix/ |
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