CNORfeeder

DOI:10.18129 / B9.bioc.CNORfeeder

这是发展cnnorfeeder版本;稳定版请参见CNORfeeder．

集成CellNOptR以添加缺失的链接

Bioconductor版本:开发(3.16)

该软件包集成了文献约束和数据驱动的方法，从扰动实验推断信号网络。它允许扩展给定的网络，通过各种推断方法从数据中获得链接，并使用蛋白质物理相互作用的信息来指导和验证链接的整合。

作者:Federica Eduati [aut]， Enio Gjerga [ctb]， Attila Gabor [cre]

维护者:Attila Gabor < Attila。Gabor在uni-heidelberg.de>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("CNORfeeder")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“CNORfeeder”)

PDF	R脚本	主要插图:使用cnnorfeeder玩网络
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CellBasedAssays，CellBiology，NetworkInference，蛋白质组学，软件
版本	1.37.3
在Bioconductor	BioC 2.12 (R-3.0)(9年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.6.0)，CellNOptR(> = 1.4.0),图
进口
链接
建议	minet，catnet，Rgraphviz，RUnit，BiocGenerics，igraph
SystemRequirements
增强了	MEIGOR
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	CNORfeeder_1.37.3.tar.gz
Windows二进制	CNORfeeder_1.37.3.zip(64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	CNORfeeder_1.37.3.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CNORfeeder
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CNORfeeder
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/CNORfeeder/
软件包下载报告	下载数据