CNTools

DOI:10.18129 / B9.bioc.CNTools

这是发展CNTools版本;稳定版请参见CNTools

通过样本矩阵将分段数据转换为区域,以便进行其他高级计算分析。

Bioconductor版本:开发(3.16)

这个包提供了一些工具,可以将使用DNAcopy的分割分析输出转换为一个矩阵结构,其中重叠的段作为行,样本作为列,这样其他的计算分析就可以应用于分割数据

作者:张建华

维护者:J. Zhang

引文(从R内,输入引用(“CNTools”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("CNTools")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“CNTools”)

PDF R脚本 NCTools HowTo
PDF 参考手册

细节

biocViews CopyNumberVariation微阵列软件
版本 1.53.0
在Bioconductor BioC 2.5 (R-2.10)(13年)
许可证 LGPL
取决于 R(>= 2.10),方法,工具,统计,genefilter
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 cghMCR
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 CNTools_1.53.0.tar.gz
Windows二进制 CNTools_1.53.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64) CNTools_1.53.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) CNTools_1.53.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CNTools
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CNTools
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/CNTools/
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