cnvfilter

doi：10.18129/b9.bioc.cnvfilter

这是发展CNVFILTER的版本；对于稳定版本，请参阅cnvfilter。

通过使用SNV调用来识别CNV调用工具的误报

生物导体版本：开发（3.16）

CNVFILTER可以通过使用通常在通用NGS管道中获得的单个核苷酸变体（SNV）调用来识别可以丢弃的CNV。

作者：Jose Marcos Moreno-Cabrera [AUT，CRE]，伯纳特凝胶[aut]

维护者：jose marcos moreno-cabrera

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ cnvfilter”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ cnvfilter”）

html	R脚本	CNVFILTER VIGNETTE
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	库务，，，，dnaseq，，，，DataImport，，，，测序，，，，软件，，，，可视化
版本	1.11.0
在生物导体中	Bioc 3.10（R-3.6）（2。5年）
执照	艺术2.0
要看	R（> = 4.1）
进口	iranges，，，，基因组机，，，，总结性特征，，，，pracma，，，，区域人，，，，断言，，，，核粒子，，，，库务，图形，utils，变体，，，，rsamtools，，，，GenomeInfodB，，，，生物弦， 方法
链接
建议	尼特，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19.masked，，，，rmarkDown
系统要求
增强
URL	https://github.com/jpuntomarcos/cnvfilter
BugReports	https://github.com/jpuntomarcos/cnvfilter/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	cnvfilter_1.11.0.tar.gz
Windows二进制	cnvfilter_1.11.0.zip（仅64位）
MacOS 10.13（高山脉）	cnvfilter_1.11.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cnvfilter
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/cnvfilter
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/cnvfilter/
软件包下载报告	下载统计