cnvgears

doi：10.18129/b9.bioc.cnvgears

这是发展CNVGEARS的版本；对于稳定版本，请参阅cnvgears。

一个函数框架，要组合，分析和解释CNV调用结果

生物导体版本：开发（3.16）

该软件包包含一组功能，可以在CNV上执行几种类型的处理和分析，以呼叫管道/算法以集成方式和不论原始数据类型（SNP Array或ngs）而产生。它提供了将多个CNV调用结果组合到单个对象，过滤它们，计算CNVR（CNV区域）和继承模式，检测基因负载等等的功能。该包装最适合于人类家庭的同伙研究。

作者：Simone Montalbano [CRE，AUT]

维护者：Simone Montalbano

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ cnvgears”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ cnvgears”）

html	R脚本	CNVGEARS软件包
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	预处理，，，，软件，，，，工作流程
版本	1.5.0
在生物导体中	Bioc 3.13（R-4.1）（1年）
执照	GPL-3
要看	r（> = 4.1），Data.Table
进口	GGPLOT2
链接
建议	变体，，，，延迟，，，，尼特，，，，Biomart，，，，evobir，，，，rmarkDown，，，，DevTools，，，，牛仔图，，，，用这个，，，，秤，，，，测试，，，，基因组机，，，，CN. -ops，，，，r.utils
系统要求
增强
URL
BugReports	https://github.com/sinomem/cnvgears/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	cnvgears_1.5.0.tar.gz
Windows二进制	cnvgears_1.5.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	cnvgears_1.5.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cnvgears
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/cnvgears
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/cnvgears/
软件包下载报告	下载统计