CellNOptR

DOI:10.18129 / B9.bioc.CellNOptR

这是发展CellNOptR版本;稳定版请参见CellNOptR．

利用先验知识网络和摄动数据训练信号网络布尔逻辑模型

Bioconductor版本:开发(3.16)

该包基于先前的知识网络和一组数据扰动网络中的节点，对信号通路的布尔逻辑网络进行优化。

作者:Thomas Cokelaer [aut]， Federica Eduati [aut]， Aidan MacNamara [aut]， S Schrier [ctb]， Camille Terfve [aut]， Enio Gjerga [ctb]， Attila Gabor [cre]

维护者:Attila Gabor < Attila。Gabor在uni-heidelberg.de>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("CellNOptR")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“CellNOptR”)

超文本标记语言	R脚本	利用先验知识网络和CellNOptR扰动数据训练信号网络布尔逻辑模型
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细节

biocViews	CellBasedAssays，CellBiology，ImmunoOncology，网络，通路，蛋白质组学，软件，TimeCourse
版本	1.43.1
在Bioconductor	BioC 2.9 (R-2.14)(10.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 4.0.0)，RBGL，图、方法、RCurl，Rgraphviz，XML，ggplot2，rmarkdown
进口	igraph，stringi，stringr
链接
建议	data.table，dplyr，tidyr，readr，knitr，RUnit，BiocGenerics
SystemRequirements	Graphviz版本>= 2.2
增强了	doParallel，foreach
URL
全靠我	CNORdt，CNORfeeder，CNORfuzzy，CNORode
进口我	bnem
建议我	MEIGOR
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	CellNOptR_1.43.1.tar.gz
Windows二进制	CellNOptR_1.43.1.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	CellNOptR_1.43.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CellNOptR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CellNOptR
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/CellNOptR/
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