细胞体

doi：10.18129/b9.bioc.cellid

这是发展Cellid版本；对于稳定版本，请参阅细胞体。

使用多个对应分析对单细胞基因特征的无偏提取

生物导体版本：开发（3.16）

CellID是一种无聚类的多元统计方法，用于从单细胞RNA-Seq稳健提取每细胞基因特征。CellID允许在不同供体，原始组织，模型生物和单细胞OMICS方案之间进行无偏细胞的身份识别。该软件包还可以用于探索单个单元数据中的功能途径富集。

作者：Akira Cortal [AUT，CRE]，Antonio Rausell [AUT，CTB]

维护者：akira cortal

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（decon ='devel'）biocmanager :: install（“ cellid”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Cellid”）

html	R脚本	蜂窝小插图
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	Atacseq，，，，聚类，，，，维度，，，，基因表达，，，，基因烯，，，，rnaseq，，，，Singlecell，，，，软件
版本	1.5.0
在生物导体中	Bioc 3.13（R-4.1）（1年）
执照	GPL-3 +文件执照
要看	r（> = 4.1），Seurat（> = 4.0.1），Singlecellexperiment
进口	RCPP，，，，rcpparmadillo，统计，utils，矩阵，，，，Tictoc，，，，评分，，，，Stringr，，，，irlba，，，，Data.Table，，，，胶水，，，，pbapply，，，，UMAP，，，，RTSNE，，，，网状，，，，FastMatch，，，，矩阵，，，，GGPLOT2，，，，生物比较，，，，总结性特征，，，，fgsea
链接	RCPP，，，，rcpparmadillo
建议	尼特，，，，rmarkDown，，，，生物使用，，，，测试，，，，平淡无奇，，，，ggpubr，，，，命运，，，，Ggrepel
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	cellid_1.5.0.tar.gz
Windows二进制	CellID_1.5.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	CellID_1.5.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cellid
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/cellid
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/cellid/
软件包下载报告	下载统计