cexor

doi：10.18129/b9.bioc.cexor

这是发展cexor的版本；对于稳定版本，请参阅cexor。

R包，以发现ChIP-EXO重复中的高分辨率蛋白-DNA相互作用

生物导体版本：开发（3.16）

CHIP-EXO中的特定峰值对重复。累积的Skellam分布函数用于检测每个DNA链（峰对）处的相对符号的显着归一化计数差异。然后，计算了跨生物学重复的重叠峰对的不可再现的发现率。

作者：Pedro Madrigal [AUT，CRE]

维护者：pedro madrigal

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（decon ='devel'）biocmanager :: install（“ cexor”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ cexor”）

PDF	R脚本	Cexor Vignette
PDF		参考手册
文本		执照

细节

生物浏览	chipseq，，，，覆盖范围，，，，功能基因组学，，，，峰值探测，，，，测序，，，，软件
版本	1.35.1
在生物导体中	Bioc 2.13（R-3.0）（8。5年）
执照	Artistic-2.0 |GPL-2 +文件执照
要看	r（> = 4.2.0），S4VECTORS，，，，iranges
进口	rsamtools，，，，GenomeInfodB，，，，基因组机，，，，rtracklayer，，，，IDR，，，，rcolorbrewer，，，，基因组化
链接
建议	运行，，，，生物基因，，，，生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	cexor_1.35.1.tar.gz
Windows二进制	cexor_1.35.1.zip
MacOS 10.13（高山脉）	cexor_1.35.1.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cexor
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/cexor
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/cexor/
软件包下载报告	下载统计