Chemmineob

doi:10.18129/b9.bioc.chemmineob

这是发展ChemMineOb的版本;对于稳定版本,请参阅Chemmineob

R接口到OpenBabel功能的子集

生物导体版本:开发(3.16)

ChemMineOB为Opelbabel C ++项目实现的化学形象功能的子集提供了R界面。OpenBabel是一种开源化学信息箱,其中包括用于结构格式互转换,描述符计算,复合相似性搜索等的实用程序。Chemineob的目的是使R内部可用的这些实用程序的子集,用于非开发者,Chemineob主要打算从ChemMiner用作附加包装,而不是直接使用。2021欧洲杯体育投注开户

作者:凯文·霍兰(Kevin Horan),托马斯·吉尔克(Thomas Girke)

维护者:thomas girke

引用(从r内,输入引用(“ ChemMineOb”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version ='devel')biocmanager :: install(“ chemmineob”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ ChemMineOb”)

html R脚本 Chemmineob
PDF 参考手册
文本 消息
文本 安装
文本 执照

细节

生物浏览 生物医学信息学,,,,蜂窝基,,,,化学信息学,,,,聚类,,,,DataImport,,,,基础设施,,,,代谢组学,,,,MicrotReplateassay,,,,药物遗传学,,,,药物基因组学,,,,蛋白质组学,,,,软件,,,,可视化
版本 1.35.2
在生物导体中 Bioc 2.13(R-3.0)(9年)
执照 文件执照
要看 R(> = 2.15.1),方法
进口 生物基因,,,,Zlibbioc,,,,RCPP(> = 0.11.0)
链接 BH,,,,RCPP,,,,Zlibbioc
建议 化学机器,,,,生物使用,,,,尼特,,,,Knitrbootstrap,,,,生物管理器,,,,rmarkDown
系统要求 带标头(http://openbabel.org)的OpenBabel(> = 3.0.0)。eigen3带标头。
增强 化学机器(> = 2.13.0)
URL https://github.com/girke-lab/chemmineob
取决于我
进口我 rmassbank
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 ChemMineOB_1.35.2.tar.gz
Windows二进制 ChemMineOb_1.35.2.2.zip
MacOS 10.13(高山脉) ChemMineOb_1.35.2.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chemmineob
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/chemmineob
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/chemmineob/
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