clumsid

doi：10.18129/b9.bioc.clumsid

这是发展Clumsid的版本；对于稳定版本，请参阅clumsid。

MS2光谱的聚类用于代谢物鉴定

生物导体版本：开发（3.16）

Clumsid是一种工具，可通过使用MS2光谱相似性和无监督的统计方法来帮助鉴定非目标LC-MS/MS分析中的特征。它提供功能，可提供从原始数据到可视化的完整和可定制的工作流程，并且与XMCS家族的预处理软件包可以插入。

作者：Tobias Depke [AUT，CRE]，Raimo Franke [CTB]，Mark Broenstrup [Ths]

维护者：tobias depke

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ clumsid”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Clumsid”）

html	R脚本	clumsid di-ms/ms教程
html	R脚本	Clumsid GC-EI-MS教程
html	R脚本	Clumsid Lowres教程
html	R脚本	Clumsid mtbls教程
html	R脚本	Clumsid教程
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	聚类，，，，代谢组学，，，，预处理，，，，软件
版本	1.13.0
在生物导体中	Bioc 3.9（R-3.6）（3年）
执照	麻省理工学院 +文件执照
要看	R（> = 3.6）
进口	MZR，，，，S4VECTORS，，，，dbscan，，，，rcolorbrewer，，，，猿，，，，网络，，，，ggally，，，，GGPLOT2，，，，情节，方法，utils，stats，sna，grdevices，图形，生物酶，，，，GPLOTS，，，，MSNBase
链接
建议	尼特，，，，rmarkDown，，，，测试，，，，dplyr，，，，readr，，，，Stringr，，，，马格里特，，，，clumsiddata，，，，metams，，，，metamsdata，，，，XCMS
系统要求
增强
URL	https://github.com/tdepke/clumsid
BugReports	https://github.com/tdepke/clumsid/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	clumsid_1.13.0.tar.gz
Windows二进制	clumsid_1.13.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	clumsid_1.13.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/clumsid
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/clumsid
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/clumsid/
软件包下载报告	下载统计