ComplexHeatmap

DOI:10.18129 / B9.bioc.ComplexHeatmap

这是发展ComplexHeatmap版本;稳定版请参见ComplexHeatmap．

制作复杂的热图

Bioconductor版本:开发(3.16)

复杂的热图可以有效地可视化不同来源的数据集之间的关联，并揭示潜在的模式。这里，ComplexHeatmap包提供了一种高度灵活的方式来安排多个热图，并支持各种注释图形。

作者:顾祖光

维护者:祖光谷

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("ComplexHeatmap")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“ComplexHeatmap”)

超文本标记语言		complex_heatmap.html
超文本标记语言	R脚本	最可能被问到的问题
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	测序，软件，可视化
版本	2.13.0
在Bioconductor	BioC 3.1 (R-3.2)(7年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R(>= 3.5.0)，方法，网格，图形，统计，grDevices
进口	circlize(> = 0.4.14),GetoptLong，色彩，线索，RColorBrewer，GlobalOptions(> = 0.1.0),png，消化，IRanges，matrixStats，foreach，doParallel，codetools
链接
建议	testthat(> = 1.0.0),knitr，减价，dendsort，jpeg，tiff，fastcluster，EnrichedHeatmap，dendextend(> = 1.0.1),grImport，grImport2，胶水，GenomicRanges，gridtext，pheatmap(> = 1.0.12),gridGraphics，gplots，rmarkdown，开罗
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/jokergoo/ComplexHeatmaphttps://jokergoo.github.io/ComplexHeatmap-reference/book/
全靠我	意大利苦杏酒，EnrichedHeatmap，InteractiveComplexHeatmap，收回
进口我	airpart，ASURAT，BiocOncoTK，BioNERO，blacksheepr，BloodGen3Module，催化剂，celda，CeTF，可可，可乐，COTAN，cytoKernel，DEComplexDisease，DEGreport，部，diffcyt，diffUTR，埃尔默，fCCAC，火焰，gCrisprTools，GeneTonic，GenomicSuperSignature，gmoviz，GRaNIE，爱马仕，InterCellar，iSEE，LineagePulse，MatrixQCvis，MesKit，microbiomeMarker，现代艺术博物馆，蒙娜丽莎，马斯喀特，musicatk，MWASTools，PathoStat，PeacoQC，pipeComp，POMA，profileplyr，RLSeq，sechm，裂殖体，simplifyEnrichment，singleCellTK，麻雀，海绵，TBSignatureProfiler，TCGAWorkflow，Xeva，YAPSA
建议我	artMS，bambu，BindingSiteFinder，BrainSABER，clustifyr，CNVRanger，dittoSeq，EnrichmentBrowser，gtrellis，HilbertCurve，msImpute，NanoporeRNASeq，pareg，plotgardener，projectR，proteasy，QFeatures，scDblFinder，有尖刺的，TCGAbiolinks，TCGAutils，TimeSeriesExperiment，weitrix
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	ComplexHeatmap_2.13.0.tar.gz
Windows二进制	ComplexHeatmap_2.13.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	ComplexHeatmap_2.13.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ComplexHeatmap
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ComplexHeatmap
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/ComplexHeatmap/
软件包下载报告	下载数据