库务

doi:10.18129/b9.bioc.copynumberplots

这是发展杂题的版本;对于稳定版本,请参阅库务

使用Karyoploter功能创建复制单图

生物导体版本:开发(3.16)

库务纸具有一组功能,可扩展Karyoploters功能,以创建相关数据的美丽,可定制和灵活的图。

作者:igtp.cat>的Bernat Gel 和Miriam Magallon

维护者:igtp.cat上的bernat凝胶

引用(从r内,输入引用(“库务啤酒”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ corpernumberplots”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Cerynumberplots”)

html R脚本 库务插图小插图
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 库务,,,,覆盖范围,,,,dnaseq,,,,DataImport,,,,Onechannel,,,,测序,,,,软件,,,,可视化
版本 1.13.0
在生物导体中 Bioc 3.9(R-3.6)(3年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 3.6),核粒子
进口 区域人,,,,iranges,,,,rsamtools,,,,总结性特征,,,,变体,方法,统计,GenomeInfodB,,,,基因组机,,,,CN. -ops,,,,RHDF5,UTILS
链接
建议 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,panelcn.mops,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19.masked,,,,DNACOPIGY,,,,测试
系统要求
增强
URL https://github.com/bernatgel/copynumberplots
BugReports https://github.com/bernatgel/copynumberplots/issues
取决于我
进口我 cnvfilter,,,,CNVIZ
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 coplenumberplots_1.13.0.tar.gz
Windows二进制 CAYMNUMBERPLOTS_1.13.0.ZIP
MacOS 10.13(高山脉) coplenumberplots_1.13.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/copynumberplots
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/copynumberplots
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/copynumberplots/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户