CoverageView

doi：10.18129/b9.bioc.coverageview

这是发展CoverageView的版本；对于稳定版本，请参阅CoverageView。

R的覆盖范围可视化套件

生物导体版本：开发（3.16）

该软件包为可视化基因组覆盖率概况提供了一个框架。它可用于芯片seq实验，但也可用于全基因组核小体定位实验或其他实验类型，在这些实验类型中，要有一个框架以检查覆盖范围如何分布在基因组中很重要。

作者：Ernesto Lowy

维护者：ernesto lowy

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version ='devel'）biocmanager :: install（“ CoverageView”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ CoverageView”）

PDF	R脚本	易于可视化阅读覆盖范围
PDF		参考手册

细节

生物浏览	chipseq，，，，免疫学，，，，rnaseq，，，，测序，，，，软件，，，，技术，，，，可视化
版本	1.35.0
在生物导体中	Bioc 2.14（R-3.1）（8年）
执照	艺术2.0
要看	R（> = 2.10），方法，rsamtools（> = 1.19.17），rtracklayer
进口	S4VECTORS（> = 0.7.21），iranges（> = 2.3.23），基因组机，，，，基因组签名，并行，工具
链接
建议
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	CoverageView_1.35.0.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13（高山脉）	CoverageView_1.35.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/coverageview
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/coverageView
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/coverageview/
软件包下载报告	下载统计