细胞瘤

doi:10.18129/b9.bioc.cytoml

这是发展Cytoml的版本;对于稳定版本,请参阅细胞瘤

跨平台细胞仪数据共享的门控件接口

生物导体版本:开发(3.16)

使用GatingML2.0标准的平台特异性启动来与其他软件平台交换门控细胞仪数据。

作者:迈克·江,杰克·瓦格纳

维护者:Mike Jiang

引用(从r内,输入引用(“ Cytoml”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ cytoml”)的用法

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Cytoml”)

html R脚本 Flowjo解析器
html R脚本 如何将gatingset导出到门控
html R脚本 如何将细胞库导入Gatingset
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 DataImport,,,,datarepresentation,,,,流程仪,,,,免疫学,,,,软件
版本 2.9.0
在生物导体中 Bioc 3.4(R-3.3)(5。5年)
执照 文件执照
要看 R(> = 3.5.0)
进口 Cytolib(> = 2.3.10),流核(> = 1.99.10),FlowWorkspace(> = 4.1.8),opencyto(> = 1.99.2),XML,,,,Data.Table,,,,jsonlite,,,,rbgl,,,,rgraphviz,,,,生物酶, 方法,图形,图形,utils,base64enc,,,,plyr,,,,dplyr,grdevices,方法,ggcyto(> = 1.11.4),Yaml,,,,格子,统计公司,,,,运行,,,,蒂布尔,,,,rcppparallel,,,,XML2
链接 RCPP,,,,BH(> = 1.62.0-1),rprotobuflib,,,,Cytolib,,,,Rhdf5lib,,,,rcpparmadillo,,,,rcppparallel(> = 4.4.2-1),FlowWorkspace
建议 测试,,,,FlowWorkspacedata,,,,尼特,,,,rmarkDown, 平行
系统要求 XML2,GNU MAKE,C ++ 11
增强
URL https://github.com/rglab/cytoml
BugReports https://github.com/rglab/cytoml/issues
取决于我
进口我 流动
建议我 FlowWorkspace,,,,opencyto
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Cytoml_2.9.0.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13(高山脉)
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cytoml
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/cytoml
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/cytoml/
软件包下载报告 下载统计

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  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户