这是发展Cytoml的版本;对于稳定版本,请参阅细胞瘤。
生物导体版本:开发(3.16)
使用GatingML2.0标准的平台特异性启动来与其他软件平台交换门控细胞仪数据。
作者:迈克·江,杰克·瓦格纳
维护者:Mike Jiang
引用(从r内,输入引用(“ Cytoml”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ cytoml”)的用法
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Cytoml”)
html | R脚本 | Flowjo解析器 |
html | R脚本 | 如何将gatingset导出到门控 |
html | R脚本 | 如何将细胞库导入Gatingset |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | DataImport,,,,datarepresentation,,,,流程仪,,,,免疫学,,,,软件 |
版本 | 2.9.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.4(R-3.3)(5。5年) |
执照 | 文件执照 |
要看 | R(> = 3.5.0) |
进口 | Cytolib(> = 2.3.10),流核(> = 1.99.10),FlowWorkspace(> = 4.1.8),opencyto(> = 1.99.2),XML,,,,Data.Table,,,,jsonlite,,,,rbgl,,,,rgraphviz,,,,生物酶, 方法,图形,图形,utils,base64enc,,,,plyr,,,,dplyr,grdevices,方法,ggcyto(> = 1.11.4),Yaml,,,,格子,统计公司,,,,运行,,,,蒂布尔,,,,rcppparallel,,,,XML2 |
链接 | RCPP,,,,BH(> = 1.62.0-1),rprotobuflib,,,,Cytolib,,,,Rhdf5lib,,,,rcpparmadillo,,,,rcppparallel(> = 4.4.2-1),FlowWorkspace |
建议 | 测试,,,,FlowWorkspacedata,,,,尼特,,,,rmarkDown, 平行 |
系统要求 | XML2,GNU MAKE,C ++ 11 |
增强 | |
URL | https://github.com/rglab/cytoml |
BugReports | https://github.com/rglab/cytoml/issues |
取决于我 | |
进口我 | 流动 |
建议我 | FlowWorkspace,,,,opencyto |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | Cytoml_2.9.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
MacOS 10.13(高山脉) | |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cytoml |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/cytoml |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/cytoml/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |
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