细胞动力

doi:10.18129/b9.bioc.cytotree

这是发展Cytotree的版本;对于稳定版本,请参阅细胞动力

用于流量和质量细胞仪数据的工具包

生物导体版本:开发(3.16)

用于流量和质量细胞仪数据的轨迹推理工具包。Cytotree是使用流量和质量细胞仪数据构建树状轨迹的宝贵工具。细胞动能的应用范围从降低和尺寸降低到轨迹重建和伪估计估计。它为流量和质量细胞仪数据提供了完整的分析工作流程。

作者:Yuting Dai [AUT,CRE]

维护者:在sjtu.edu.cn>的dai

引用(从r内,输入引用(“ Cytotree”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ cytototree”)的用法

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

PDF 参考手册

细节

生物浏览 蜂窝基,,,,细胞生物学,,,,聚类,,,,流程仪,,,,网络,,,,网络引导,,,,软件,,,,可视化
版本 1.7.0
在生物导体中 Bioc 3.12(R-4.0)(1。5年)
执照 GPL-3
要看 r(> = 4.0),Igraph
进口 流动,,,,RTSNE,,,,GGPLOT2,,,,命运,,,,Gmodels,,,,流动性,,,,生物酶,,,,矩阵,,,,流核,,,,SVA,,,,矩阵, 方法,mclust,,,,Prettydoc,,,,拉恩(> = 2.5),RCPP(> = 0.12.0),生物脑,,,,,,,,pheatmap,,,,散落,,,,UMAP,,,,STACTPLOT3D,,,,林玛,,,,Stringr,grdevices,网格,统计
链接 RCPP
建议 生物基因,,,,尼特,,,,rcolorbrewer,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,生物使用
系统要求
增强
URL http://www.r-project.orghttps://github.com/jhuanglab/cytotree
BugReports https://github.com/jhuanglab/cytotree/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包
Windows二进制
MacOS 10.13(高山脉)
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cytotree
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/cytotree
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/cytotree/
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  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户