这是发展Cytotree的版本;对于稳定版本,请参阅细胞动力。
生物导体版本:开发(3.16)
用于流量和质量细胞仪数据的轨迹推理工具包。Cytotree是使用流量和质量细胞仪数据构建树状轨迹的宝贵工具。细胞动能的应用范围从降低和尺寸降低到轨迹重建和伪估计估计。它为流量和质量细胞仪数据提供了完整的分析工作流程。
作者:Yuting Dai [AUT,CRE]
维护者:在sjtu.edu.cn>的dai
引用(从r内,输入引用(“ Cytotree”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ cytototree”)的用法
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
参考手册 |
生物浏览 | 蜂窝基,,,,细胞生物学,,,,聚类,,,,流程仪,,,,网络,,,,网络引导,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 1.7.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.12(R-4.0)(1。5年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | r(> = 4.0),Igraph |
进口 | 流动,,,,RTSNE,,,,GGPLOT2,,,,命运,,,,Gmodels,,,,流动性,,,,生物酶,,,,矩阵,,,,流核,,,,SVA,,,,矩阵, 方法,mclust,,,,Prettydoc,,,,拉恩(> = 2.5),RCPP(> = 0.12.0),生物脑,,,,簇,,,,pheatmap,,,,散落,,,,UMAP,,,,STACTPLOT3D,,,,林玛,,,,Stringr,grdevices,网格,统计 |
链接 | RCPP |
建议 | 生物基因,,,,尼特,,,,rcolorbrewer,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,生物使用 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | http://www.r-project.orghttps://github.com/jhuanglab/cytotree |
BugReports | https://github.com/jhuanglab/cytotree/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | |
Windows二进制 | |
MacOS 10.13(高山脉) | |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cytotree |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/cytotree |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/cytotree/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |
文档»
生物导体