解码

doi:10.18129/b9.bioc.decipher

这是发展解密的版本;对于稳定版本,请参阅解码

策划,分析和操纵生物学序列的工具

生物导体版本:开发(3.16)

一种用于解密和管理生物序列的工具集。

作者:埃里克·赖特(Erik Wright)

维护者:Erik Wright

引用(从r内,输入引用(“解密”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(decon ='devel')biocmanager :: install(“ decipher”)的用法

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Decipher”)

PDF R脚本 分类序列
PDF R脚本 设计组特定的鱼类探针
PDF R脚本 设计组特定的引物
PDF R脚本 设计微阵列探针
PDF R脚本 设计引物可以产生特定组的特定签名
PDF R脚本 在序列中检测晦涩的串联重复
PDF R脚本 查找嵌合序列
PDF R脚本 入门解密
PDF R脚本 用treeline生长系统发育树
PDF R脚本 r中多序列对齐的艺术
PDF R脚本 RNA的双重寿命:发现非编码RNA
PDF R脚本 基因发现的魔力
PDF 参考手册

细节

生物浏览 结盟,,,,聚类,,,,DataImport,,,,遗传,,,,遗传学,,,,免疫学,,,,微阵列,,,,微生物组,,,,QualityControl,,,,测序,,,,软件,,,,可视化,,,,全媒体,,,,qpcr
版本 2.25.0
在生物导体中 Bioc 2.9(R-2.14)(10。5年)
执照 GPL-3
要看 r(> = 3.5.0),生物弦(> = 2.59.1),rsqlite(> = 1.1),统计,并行
进口 方法,DBI,,,,S4VECTORS,,,,iranges,,,,xvector
链接 生物弦,,,,S4VECTORS,,,,iranges,,,,xvector
建议
系统要求
增强
URL
取决于我 评估员,,,,Sangeranalyser,,,,Synextend
进口我 essionorfdata,,,,米娅,,,,OpenPrimer
建议我 微生物剂量
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 decipher_2.25.0.tar.gz
Windows二进制 DECIPHER_2.25.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) DECIPHER_2.25.0.TGZ
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/decipher
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/解密
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/decipher/
软件包下载报告 下载统计

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  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户