degraph

doi：10.18129/b9.bioc.degraph

这是发展degraph的版本；对于稳定版本，请参阅degraph。

图上的两样本测试

生物导体版本：开发（3.16）

Degraph实施了最新的假设检验方法，该方法直接评估了在两个条件之间是否差异表达特定基因网络。这将与更古典的两步方法进行对比，该方法首先测试了单个基因，然后测试基因集以在差异表达的基因中富集。这些最近的方法考虑了网络的拓扑结构，以产生更强大的检测程序。Degraph提供了轻松测试所有基因表达数据集的差分表达的方法，以及可视化结果的工具。

作者：Laurent Jacob，Pierre Neuvial和Sandrine Dudoit

维护者：laurent Jacob

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ degraph”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ degraph”）

PDF	R脚本	DEGRAPH：基因网络的差异表达测试
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	决策树，，，，差异性，，，，GraphandNetwork，，，，微阵列，，，，网络，，，，NetworkEnrichment，，，，软件
版本	1.49.0
在生物导体中	Bioc 2.7（R-2.12）（11。5年）
执照	GPL-3
依靠	r（> = 2.10.0），r.utils
进口	图形，，，，kegggraph，，，，格子，，，，mvtnorm，，，，R.Methodss3，，，，rbgl，，，，rgraphviz，，，，rrcov，，，，ncigraph
链接
建议	公司，，，，字段，，，，图形，，，，kegggraph，，，，格子，，，，Marray，，，，rbgl，，，，rrcov，，，，rgraphviz，，，，ncigraph
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	degraph_1.49.0.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13（高山脉）
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/degraph
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/degraph
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/degraph/
软件包下载报告	下载统计