DEGseq

DOI:10.18129 / B9.bioc.DEGseq

这是发展DEGseq版本;稳定版请参见DEGseq．

从RNA-seq数据中识别差异表达基因

Bioconductor版本:开发(3.17)

DEGseq是一个R包，用于从RNA-Seq数据中识别差异表达基因。

作者:王丽坤和王曦。

维护者:王丽坤

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("DEGseq")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“DEGseq”)

PDF	R脚本	DEGseq
PDF		参考手册

细节

biocViews	DifferentialExpression，GeneExpression，ImmunoOncology，预处理，RNASeq，软件
版本	1.53.0
在Bioconductor	BioC 2.5 (R-2.10)(13年)
许可证	LGPL (> = 2)
取决于	R (>= 2.8.0)，qvalue、方法
进口	图形，grDevices，方法，统计，utils
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	DEGseq_1.53.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制文件(x86_64)
macOS二进制文件(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DEGseq
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/DEGseq
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/DEGseq/
软件包下载报告	下载数据