DExMA

DOI:10.18129 / B9.bioc.DExMA

这是发展DExMA版本;稳定发布版本请参见DExMA．

差异表达元分析

Bioconductor版本:开发(3.16)

考虑可能存在的缺失基因，执行基因表达元分析的所有步骤。它提供了必要的功能，能够执行不同的基因表达元分析方法。此外，它还包含应用质量控制、下载GEO数据集和显示结果的图形表示的功能。

作者:胡安·安东尼奥Villatoro-García [aut, cre]，佩德罗Carmona-Sáez [aut]

维护者:Juan Antonio Villatoro-García

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("DExMA")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“DExMA”)

PDF	R脚本	使用DExMA包进行差异表达元分析
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression，GeneExpression，质量控制，软件，StatisticalMethod
版本	1.5.3
在Bioconductor公司	BioC 3.13 (R-4.1)(1年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 4.1)，DExMAdata
进口	Biobase，GEOquery，嫁祸于，limma，pheatmap，plyr，尺度，snpStats，股东价值分析，沼泽，统计，方法，效用，bnstruct，RColorBrewer, grDevices
链接
建议	BiocStyle，qpdf，BiocGenerics，RUnit
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
给我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	DExMA_1.5.3.tar.gz
Windows二进制	DExMA_1.5.3.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	DExMA_1.5.3.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/DExMA
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/DExMA
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/DExMA/
软件包下载报告	下载数据