DNACOPIGY

doi:10.18129/b9.bioc.dnacopy

这是发展DNACOPY的版本;对于稳定版本,请参阅DNACOPIGY

DNA拷贝数数据分析

生物导体版本:开发(3.16)

实现循环二进制分割(CBS)算法以段DNA拷贝数数据,并识别具有异常拷贝数的基因组区域。

作者:Venkatraman E. Seshan,Adam Olshen

维护者:MSKCC.org>的Venkatraman E. Seshan

引用(从r内,输入引用(“ Dnacopy”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ dnacopy”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Dnacopy”)

PDF R脚本 DNACOPIGY
PDF 参考手册

细节

生物浏览 库务,,,,微阵列,,,,软件
版本 1.71.0
在生物导体中 Bioc 1.6(R-2.1)或更早(> 17年)
执照 GPL(> = 2)
要看
进口
链接
建议
系统要求
增强
URL
取决于我 CGHCALL,,,,CGHMCR,,,,克隆性,,,,犯罪,,,,属属
进口我 adacgh2,,,,Aneufinder,,,,冠军,,,,CN.Farms,,,,cnanorm,,,,CNVRD2,,,,contibait,,,,Conumee,,,,copywriter,,,,Gwastools,,,,maftools,,,,MDTS,,,,Medips,,,,Methcp,,,,最小值,,,,QDNASEQ,,,,RCGH,,,,repitools,,,,范围,,,,Snapcgh
建议我 Beadarraysnp,,,,CN. -ops,,,,库务,,,,fastseg,,,,nullranges,,,,芝麻
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 dnacopy_1.71.0.tar.gz
Windows二进制 dnacopy_1.71.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) dnacopy_1.71.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dnacopy
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/dnacopy
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/dnacopy/
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