这是发展DSS的版本;对于稳定版本,请参阅DSS。
生物导体版本:开发(3.16)
DSS是一个R库,对基于计数的测序数据进行不同的分析。它从RNA-Seq检测到差异表达的基因(DEG),并从甲基化的基因座或区域(DML/DMR)中检测到亚硫酸盐测序(BS-SEQ)。DSS的核心是一种新的分散收缩方法,用于估算γ-波森或β-二比分布的分散参数。
作者:hao wu
维护者:hao wu
引用(从r内,输入引用(“ DSS”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(decon ='devel')biocmanager :: install(“ dss”)的用法
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ DSS”)
html | R脚本 | DSS用户指南 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | DNAMETHYLATY,,,,差异性,,,,差甲基化,,,,基因表达,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件 |
版本 | 2.45.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.11(R-2.15)(9。5年) |
执照 | GPL |
要看 | r(> = 3.5.0),方法,生物酶,,,,生物比较,,,,BSSEQ, 平行 |
进口 | UTIT,图形,统计,花纹,矩阵 |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | 北方,,,,dmrcate,,,,亲,,,,metaseqr2,,,,Methcp,,,,甲基化 |
建议我 | 饼干,,,,Methrix,,,,纳米塞维兹,,,,恰当的 |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | dss_2.45.0.tar.gz |
Windows二进制 | dss_2.45.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | dss_2.45.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dss |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/dss |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/dss/ |
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