DeconRNASeq

DOI:10.18129 / B9.bioc.DeconRNASeq

这是发展版本的DeconRNASeq;稳定发布版本请参见DeconRNASeq．

mRNA-Seq数据的异质组织样本反褶积

Bioconductor版本:开发(3.16)

DeconSeq是一个R包，用于基于mRNA-Seq数据的异质组织反褶积。它将mRNA-Seq中异质细胞群的表达水平建模为来自不同组成细胞类型的表达的加权平均值，并预测单个表达谱的细胞类型比例。

作者:Ting Gong Joseph D. Szustakowski < Joseph。Szustakowski在novartis.com>上写道

维护人员:Ting Gong

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("DeconRNASeq")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“DeconRNASeq”)

PDF	R脚本	DeconRNASeq演示
PDF		参考手册

细节

biocViews	DifferentialExpression，软件
版本	1.39.0
在Bioconductor公司	BioC 2.11 (R-2.15)(9.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 2.14.0)，limSolve，pcaMethods，ggplot2、网格
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我	适应
给我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	DeconRNASeq_1.39.0.tar.gz
Windows二进制	DeconRNASeq_1.39.0.zip(64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	DeconRNASeq_1.39.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/DeconRNASeq
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/DeconRNASeq
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/DeconRNASeq/
软件包下载报告	下载数据