ENmix

DOI:10.18129 / B9.bioc.ENmix

这是发展ENmix版本;稳定版请参见ENmix．

Illumina DNA甲基化BeadChip的质量控制和分析工具

Bioconductor版本:开发(3.16)

Illumina DNA甲基化阵列的质量控制、分析和可视化工具包。

作者:徐宗礼[cre, aut]，牛良[aut]， Jack Taylor [ctb]

维护者:徐宗丽

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("ENmix")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“ENmix”)

PDF	R脚本	ENmix用户指南
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	BatchEffect，DNAMethylation，DataImport，DifferentialMethylation，表观遗传学，ImmunoOncology，MethylationArray，微阵列，多通道，归一化，OneChannel，预处理，PrincipalComponent，质量控制，回归，软件，TwoChannel
版本	1.33.0
在Bioconductor	BioC 3.1 (R-3.2)(7.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(>= 3.5.0)平行，doParallel，foreach，SummarizedExperiment,统计数据
进口	grDevices、图形preprocessCore，matrixStats，方法，utils，geneplotter，嫁祸于，minfi，RPMM，illuminaio，dynamicTreeCut，IRanges，gtools，Biobase，ExperimentHub，AnnotationHub，genefilter，gplots，quadprog，S4Vectors
链接
建议	minfiData，RUnit，BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	ENmix_1.33.0.tar.gz
Windows二进制	ENmix_1.33.0.zip(64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	ENmix_1.33.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ENmix
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ENmix
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/ENmix/
软件包下载报告	下载数据