实验值

doi:10.18129/b9.bioc.supperimentsubset

这是发展实验值的版本;对于稳定版本,请参阅实验值

通过生物导体实验对象管理数据子集

生物导体版本:开发(3.16)

实验对象(例如汇总功效或单链光线)是一个或多个类似矩阵的测定的数据容器,以及相关的行数据和列数据。通常只需要一个原始数据的子集来进行下游分析。例如,在分析之前,滤除质量较差的样品将需要排除某些列。实验值对象是一个容器,可以有效地管理相同数据的不同子集,而无需为每个新子集做单独的对象。

作者:Irzam Sarfraz [AUT,CRE],穆罕默德·阿西夫[aut,ths],约书亚·D·坎贝尔[aut]

维护者:irzam sarfraz

引用(从r内,输入引用(“实验材料”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version ='devel')biocmanager :: install(“ passimimentsubset”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

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browsevignettes(“实验值”)

html R脚本 实验材料类简介
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 DataImport,,,,datarepresentation,,,,基础设施,,,,软件
版本 1.7.0
在生物导体中 Bioc 3.12(R-4.0)(1。5年)
执照 麻省理工学院 +文件执照
要看 r(> = 4.0.0),总结性特征,,,,Singlecellexperiment,,,,Spatiaxlexperiment,,,,树木化的特殊性
进口 方法,矩阵,,,,S4VECTORS
链接
建议 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,COVR,统计斯克兰,,,,评分,,,,SCDS,,,,tenxpbmcdata,,,,呼吸道
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

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源包 实验ubset_1.7.0.tar.gz
Windows二进制 实验ubset_1.7.0.zip
MacOS 10.13(高山脉)
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/experimentsubset
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/bersimententsubset
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/experimentsubset/
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