ExploreModelMatrix

DOI:10.18129 / B9.bioc.ExploreModelMatrix

这是发展ExploreModelMatrix版本;稳定发布版本请参见ExploreModelMatrix．

设计矩阵的图形探索

Bioconductor版本:开发(3.16)

给定一个样本数据表和一个设计公式，ExploreModelMatrix生成一个交互式应用程序，用于探索结果设计矩阵。这有助于解释模型系数和在(广义)线性模型中构造适当的对比。还可以生成静态可视化。

作者:Charlotte Soneson [aut, cre]，费德里科·马里尼[法国]，迈克尔·洛夫[au]，弗洛里安·盖尔[au]，迈克尔·施塔德勒[au]

维护人员:Charlotte Soneson

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager"， quiet = TRUE)) #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("ExploreModelMatrix")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“ExploreModelMatrix”)

超文本标记语言	R脚本	ExploreModelMatrix
超文本标记语言	R脚本	ExploreModelMatrix-deploy
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DifferentialExpression，ExperimentalDesign，回归，软件
版本	1.9.0
Bioconductor自	BioC 3.11 (R-4.0)(2年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于
进口	闪亮的(> = 1.5.0),shinydashboard，DT，cowplot跑龙套,dplyr，magrittr，tidyr，ggplot2、统计数据、方法rintrojs，尺度，宠物猫，质量，limma，S4Vectors，shinyjs
链接
建议	testthat(> =魅惑,knitr，rmarkdown，htmltools，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/csoneson/ExploreModelMatrix
BugReports	https://github.com/csoneson/ExploreModelMatrix/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	ExploreModelMatrix_1.9.0.tar.gz
Windows二进制	ExploreModelMatrix_1.9.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	ExploreModelMatrix_1.9.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ExploreModelMatrix
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ExploreModelMatrix
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/ExploreModelMatrix/
包下载报告	下载数据