fgnet

doi：10.18129/b9.bioc.fgnet

这是发展FGNET的版本；对于稳定版本，请参阅fgnet。

来自生物富集分析的功能基因网络

生物导体版本：开发（3.16）

从多个注释空间中的富集分析聚类中构建和可视化功能基因和项网络。该软件包包括图形用户界面（GUI）和功能，以通过David，Gen​​eterm Linker，GAGE（GSEA）和TOPGO执行功能丰富分析。

作者：Sara Aibar，Celia Fontanillo，Conrad Droste和Javier de Las Rivas。

维护者：sara aibar

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（decon ='devel'）biocmanager :: install（“ fgnet”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ fgnet”）

html	R脚本	fgnet
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	注解，，，，聚类，，，，功能基因组学，，，，去，，，，基因烯，，，，网络，，，，NetworkEnrichment，，，，途径，，，，软件，，，，可视化
版本	3.31.0
在生物导体中	Bioc 2.13（R-3.0）（8。5年）
执照	GPL（> = 2）
要看	R（> = 4.2.0）
进口	Igraph（> = 0.6），HWRITER，，，，r.utils，，，，XML，，，，plotrix，，，，RESHAPE2，，，，rcolorbrewer，，，，PNG，方法，统计，utils，图形，grdevices
链接
建议	rcurl，，，，量规，，，，topgo，，，，go.db，，，，Reactome.db，，，，运行，，，，生物基因，，，，org.sc.sgd.db，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，AnnotationDbi，，，，生物管理器
系统要求
增强
URL	http://www.cicancer.org
取决于我
进口我	Intramirexplorer
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	fgnet_3.31.0.tar.gz
Windows二进制	fgnet_3.31.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	fgnet_3.31.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fgnet
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/fgnet
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/fgnet/
软件包下载报告	下载统计