火焰

doi：10.18129/b9.bioc.flame

这是发展火焰的版本；对于稳定版本，请参阅火焰。

火焰：长期读取RNA-seq数据中突变和剪接的全长分析

生物导体版本：开发（3.16）

从大量和单细胞长读RNA-seq数据的半监督同工型检测和注释。火焰提供用于分析同工型的自动管道以及手动执行的中间功能。

作者：Tian Luyi [aut]，Voogd Oliver [AUT，CRE]，Schuster Jakob [aut]，Wang ChangQing [aut]，Su Shian [aut]，Ritchie Matthew [CTB]

维护者：vuogd oliver

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（decon ='devel'）biocmanager :: install（“ flames”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“火焰”）

html	R脚本	火焰
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	替代方案，，，，DataImport，，，，差速器，，，，基因表达，，，，rnaseq，，，，Singlecell，，，，软件，，，，转录组学
版本	1.3.3
在生物导体中	Bioc 3.14（R-4.1）（0.5岁）
执照	GPL（> = 2）
要看
进口	蛇怪，，，，网状，，，，Singlecellexperiment，，，，总结性特征，，，，rsamtools，utils，Zlibbioc，，，，评分，，，，dplyr，，，，花花公子，，，，马格里特，，，，S4VECTORS，，，，砍伐，统计rtracklayer，，，，Igraph，，，，GGBIO，，，，基因组机，，，，矩阵，，，，生物基因，，，，GGPLOT2，，，，斯克兰，，，，复杂的图像，，，，rcolorbrewer，，，，循环， 网格，栅格，，，，牛仔图，，，，Stringr，，，，小班夫，，，，GenomeInfodB，，，，用，，，，生物弦，，，，GenomicFeatures
链接	RCPP，，，，Rhtslib，，，，Zlibbioc
建议	生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，降价，，，，Biocfilecache
系统要求	GNU MAKE，C ++ 11
增强
URL	https://github.com/olivervoogd/flames
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	flames_1.3.3.3.tar.gz
Windows二进制	flames_1.3.3.3.zip（仅64位）
MacOS 10.13（高山脉）	flames_1.3.3.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/flames
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/火焰
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/flames/
软件包下载报告	下载统计