Gosemsim

doi：10.18129/b9.bioc.gosemsim

这是发展Gosemsim的版本；对于稳定版本，请参阅Gosemsim。

Go-Terms语义相似性度量

生物导体版本：开发（3.16）

基因本体论（GO）注释的语义比较提供了计算基因和基因组之间相似性的定量方法，并已成为许多生物信息学分析方法的重要基础。Gosemsim是用于语义相似性计算，GO术语，GO术语，基因产品和基因簇之间的R套件。Gosemsim分别实施了Resnik，Schlicker，Jiang，Lin和Wang提出的五种方法。

作者：广琴Yu [AUT，CRE]，Alexey Stukalov [CTB]，Pingfan Guo [CTB]，Chuanle Xiao [CTB]，LluísRevillaSancho [CTB]

维护者：gmail.com> guangchuang yu

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version ='devel'）biocmanager :: install（“ gosemsim”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Gosemsim”）

html	R脚本	Gosemsim
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	注解，，，，聚类，，，，去，，，，网络，，，，途径，，，，软件
版本	2.23.0
在生物导体中	Bioc 2.4（R-2.9）（13年）
执照	艺术2.0
要看	R（> = 3.5.0）
进口	AnnotationDbi，，，，go.db，方法，utils
链接	RCPP
建议	AnnotationHub，，，，生物管理器，，，，clusterProfiler，，，，剂量，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，org.hs.eg.db，，，，Prettydoc，，，，测试，，，，rocr
系统要求
增强
URL	https://yulab-smu.top/biomedical-knowledge-mining-book/
BugReports	https://github.com/yulab-smu/gosemsim/issues
取决于我	翻译
进口我	clusterProfiler，，，，剂量，，，，富集，，，，Gapgom，，，，网眼，，，，rcpi，，，，rrvgo，，，，简化，，，，Viseago
建议我	生物剂，，，，Epinem，，，，小伙子，，，，精灵
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	gosemsim_2.23.0.tar.gz
Windows二进制	gosemsim_2.23.0.zip（仅64位）
MacOS 10.13（高山脉）	gosemsim_2.23.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gosemsim
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/gosemsim
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/gosemsim/
软件包下载报告	下载统计