GOstats

DOI:10.18129 / B9.bioc.GOstats

这是发展GOstats版本;稳定发布版本请参见GOstats．

操作GO和微阵列的工具

Bioconductor版本:开发(3.13)

一套与GO和微阵列数据交互的工具。各种基本的图形操作工具，假设检验和其他简单的计算。

作者:Robert Gentleman [aut]， Seth Falcon [ctb]， Robert Castelo [ctb]， Bioconductor Package Maintainer [cre]

维护者:Bioconductor包维护者< Bioconductor .org>的维护者

安装

要安装此包，启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require .packages("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用bio devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("GOstats")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“GOstats”)

PDF	R脚本	对不常见的模型生物的超几何测试
PDF	R脚本	使用GOstats进行超几何测试
PDF	R脚本	使用GOstats可视化数据
PDF		参考手册

细节

biocViews	注释，去，GeneExpression，GeneSetEnrichment，GraphAndNetwork，微阵列，MultipleComparison，通路，软件
版本	2.57.0
Bioconductor自	BioC 1.6 (R-2.1)或更早的版本(> 15.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 2.10),Biobase(> = 1.15.29),类别(> = 2.43.2),图
进口	方法、统计stats4,AnnotationDbi(> = 0.0.89),GO.db(> = 1.13.0),RBGL，注释(> = 1.13.2),AnnotationForge，Rgraphviz
链接
建议	hgu95av2.db(> = 1.13.0),所有，乘，genefilter，RColorBrewer，xtable，SparseM，GSEABase，geneplotter，org.Hs.eg.db，RUnit，BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	MineICA，PloGO2，RDAVIDWebService
进口我	affycoretools，吸引，categoryCompare，GmicR，理想的，MIGSA，miRLAB，pcaExplorer，ReportingTools，scTensor，systemPipeR
建议我	a4，BiocCaseStudies，类别，eisa，fastLiquidAssociation，GSEAlm，interactiveDisplay，MineICA，中长期规划，qpgraph，RnBeads，安全
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	GOstats_2.57.0.tar.gz
Windows二进制	GOstats_2.57.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	GOstats_2.57.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GOstats
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GOstats
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/GOstats/
包下载报告	下载数据