GeneExpressionSignature

DOI:10.18129 / B9.bioc.GeneExpressionSignature

这是发展GeneExpressionSignature版本;稳定的发布版本请参见GeneExpressionSignature．

基于基因表达签名的相似性度量

生物导体版本:开发(3.14)

该包给出了基因表达签名的实现及其与每个签名的距离。基因表达特征表示为一组表达与某一生物感兴趣状态相关的基因。使用基于Kolmogorov-Smirnov统计量的非参数、基于秩的模式匹配策略定义其距离。基因表达签名及其距离可用于检测药物、疾病和感兴趣的生物状态签名之间的相似性。

作者:杨操[aut, cre]，李飞[ctb]，韩璐[ctb]

维护人:杨操

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("GeneExpressionSignature")

有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“GeneExpressionSignature”)

超文本标记语言	R脚本	GeneExpressionSignature
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression，软件
版本	1.39.0
Bioconductor自	BioC 2.9 (R-2.14)(9.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 4.0)
进口	Biobase、统计数据、方法
链接
建议	apcluster，GEOquery，knitr，rmarkdown，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/yiluheihei/GeneExpressionSignature
BugReports	https://github.com/yiluheihei/GeneExpressionSignature/issues/
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	GeneExpressionSignature_1.39.0.tar.gz
Windows二进制	GeneExpressionSignature_1.39.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	GeneExpressionSignature_1.39.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GeneExpressionSignature
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GeneExpressionSignature
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/GeneExpressionSignature/
包下载报告	下载数据