Genegeneinter

doi：10.18129/b9.bioc.genegeneinter

这是发展GeneGeneinter的版本；对于稳定版本，请参阅Genegeneinter。

测试基因相互作用的工具

生物导体版本：开发（3.16）

该软件包的目的是提出几种在病例对照关联研究中测试基因相互作用的方法。可以通过汇总在SNP级别（SSI）执行的SNP-SNP相互作用测试或使用Gene-Gene多维方法（GGI）方法来完成此类测试。该软件包还提出了用于图形显示结果的工具。 。

作者：Mathieu Emily [AUT，CRE]，Nicolas Sounac [CTB]，Florian Kroell [CTB]，Magalie Houee-Bigot [aut]

维护者：Mathieu Emily

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化了Bioc Devel Biocmanager :: install（version ='devel'）biocmanager :: install（“ GeneGeneInter）（“ GeneGeneInter”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Genegeneinter”）

PDF	R脚本	Genegeneinter简介
PDF	R脚本	成对交互测试
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	遗传因素，，，，遗传学，，，，Genomewideassociation，，，，SNP，，，，软件
版本	1.23.0
在生物导体中	Bioc 3.4（R-3.3）（5。5年）
执照	GPL（> = 2）
依靠	R（> = 4.0）
进口	snpstats，，，，mvtnorm，，，，rsamtools，，，，Igraph，，，，克恩拉布，，，，Factominer，，，，iranges，，，，基因组机，，，，Data.Table，grdevices，图形，统计，utils，方法
链接
建议
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	genegeneinter_1.23.0.tar.gz
Windows二进制	genegeneinter_1.23.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	genegeneinter_1.23.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/genegeneinter
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/genegeneinter
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/genegeneinter/
软件包下载报告	下载统计