这是发展GeneStructureTools版本;稳定发布版本请参见GeneStructureTools.
Bioconductor版本:开发(3.16)
GeneStructureTools可用于在硅片中创建替代剪接事件,并分析这对功能基因产物的潜在影响。
作者:Beth Signal
维护器:贝丝信号
引用(从R中,输入引用(“GeneStructureTools”)
):
要安装此包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用bio devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("GeneStructureTools")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“GeneStructureTools”)
超文本标记语言 | R脚本 | GeneStructureTools简介 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | AlternativeSplicing,DifferentialSplicing,FunctionalPrediction,ImmunoOncology,RNASeq,软件,转录组 |
版本 | 1.17.0 |
在Bioconductor公司 | BioC 3.7 (R-3.5)(4年) |
许可证 | BSD_3_clause +文件许可证 |
取决于 | |
进口 | Biostrings,GenomicRanges,IRanges,data.table,plyr,stringdist,stringr,S4Vectors,BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10, stats, utils,Gviz,rtracklayer、方法 |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
给我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | GeneStructureTools_1.17.0.tar.gz |
Windows二进制 | GeneStructureTools_1.17.0.zip(64位) |
macOS 10.13 (High Sierra) | GeneStructureTools_1.17.0.tgz |
源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/GeneStructureTools |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GeneStructureTools |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/GeneStructureTools/ |
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