GenomicDataCommons

doi：10.18129/b9.bioc.genomicdatacommons

这是发展GenomicDataCommons的版本；对于稳定版本，请参阅GenomicDataCommons。

NIH / NCI基​​因组数据共享访问

生物导体版本：开发（3.16）

通过编程方式访问NIH / NCI基​​因组数据共享恢复服务。

作者：Martin Morgan [AUT]，Sean Davis [AUT，CRE]，Marcel Ramos [CTB]

维护者：sean davis

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化了Bioc Devel Biocmanager :: install（version（version ='devel'）biocmanager :: install（“ GenomicicDataCommons”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ GenomicDataCommons”）

html	R脚本	访问NCI基因组数据共享简介
html	R脚本	多年来的问题和答案
html	R脚本	体细胞突变数据
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	DataImport，，，，测序，，，，软件
版本	1.21.1
在生物导体中	Bioc 3.5（R-3.4）（5年）
执照	艺术2.0
要看	r（> = 3.4.0），马格里特
进口	统计，httr，，，，XML2，，，，jsonlite，utils，rlang，，，，readr，，，，基因组机，，，，iranges，，，，dplyr，，，，Rappdirs，，，，蒂布尔
链接
建议	生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，DT，，，，测试，，，，ListViewer，，，，GGPLOT2，，，，基因组签名，，，，rsamtools，，，，生物比较，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg38.nown，，，，变体，，，，maftools，，，，r.utils，，，，Data.Table
系统要求
增强
URL	//www.andersvercelli.com/packages/genomicdatacommonshttp://github.com/bioconductor/genomicdatacommons
BugReports	https://github.com/bioconductor/genomicdatacommons/issues/new
取决于我
进口我	gdcrnatools，，，，tcgautils
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	GenomicDataCommons_1.21.1.tar.gz
Windows二进制	GenomicDataCommons_1.21.1.zip
MacOS 10.13（高山脉）	GenomicDataCommons_1.21.1.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/genomicdatacommons
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/genomicdatacommons
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/genomicdatacommons/
软件包下载报告	下载统计