这是发展Gladiatox的版本;对于稳定版本,请参阅Gladiatox。
生物导体版本:开发(3.14)
Gladiatox R软件包是一种开源,灵活的解决方案,用于生物医学研究中的高内含物筛选数据处理和报告。Gladiatox利用了TCPL核心功能,并提供了许多扩展:它提供了一个网络服务解决方案来获取原始数据;它计算严重性得分并导出TOXPI格式化文件;此外,它包含一套功能,以生成PDF报告,以进行质量控制和数据处理。
作者:Vincenzo Belcastro [AUT,CRE],Dayne L Filer [AUT],Stephane Cano [AUT]
维护者:PMP S.A. R支持
引用(从r内,输入引用(“ dlwiatox”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)#以下初始化了Bioc Devel Biocmanager :: Install(decon ='devel')biocmanager :: install(“ devel')biocmanager :: install(“ devel'devel')
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ glwiatox”)
html | R脚本 | Gladiatox |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 正常化,,,,预处理,,,,QualityControl,,,,软件,,,,工作流程 |
版本 | 1.9.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.9(R-3.6)(2年) |
执照 | GPL-2 |
要看 | r(> = 3.6.0),Data.Table(> = 1.9.4) |
进口 | DBI,,,,rmysql,,,,rsqlite,,,,numderiv,,,,rcolorbrewer,并行,统计,方法,图形,grdevices,Xtable, 工具,酿造,,,,Stringr,,,,rjsonio,,,,GGPLOT2,,,,Ggrepel,,,,花花公子,utils,rcurl,,,,XML |
链接 | |
建议 | roxygen2,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,生物使用 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | Gladiatox_1.9.0.tar.gz |
Windows二进制 | Gladiatox_1.9.0.zip(32-和64位) |
MacOS 10.13(高山脉) | Gladiatox_1.9.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gladiatox |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/thgiatox |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/gladiatox/ |
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