Gladiatox

doi:10.18129/b9.bioc.gladiatox

这是发展Gladiatox的版本;对于稳定版本,请参阅Gladiatox

用于处理高内容筛选数据的R包

生物导体版本:开发(3.14)

Gladiatox R软件包是一种开源,灵活的解决方案,用于生物医学研究中的高内含物筛选数据处理和报告。Gladiatox利用了TCPL核心功能,并提供了许多扩展:它提供了一个网络服务解决方案来获取原始数据;它计算严重性得分并导出TOXPI格式化文件;此外,它包含一套功能,以生成PDF报告,以进行质量控制和数据处理。

作者:Vincenzo Belcastro [AUT,CRE],Dayne L Filer [AUT],Stephane Cano [AUT]

维护者:PMP S.A. R支持

引用(从r内,输入引用(“ dlwiatox”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)#以下初始化了Bioc Devel Biocmanager :: Install(decon ='devel')biocmanager :: install(“ devel')biocmanager :: install(“ devel'devel')

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ glwiatox”)

html R脚本 Gladiatox
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 正常化,,,,预处理,,,,QualityControl,,,,软件,,,,工作流程
版本 1.9.0
在生物导体中 Bioc 3.9(R-3.6)(2年)
执照 GPL-2
要看 r(> = 3.6.0),Data.Table(> = 1.9.4)
进口 DBI,,,,rmysql,,,,rsqlite,,,,numderiv,,,,rcolorbrewer,并行,统计,方法,图形,grdevices,Xtable, 工具,酿造,,,,Stringr,,,,rjsonio,,,,GGPLOT2,,,,Ggrepel,,,,花花公子,utils,rcurl,,,,XML
链接
建议 roxygen2,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,生物使用
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Gladiatox_1.9.0.tar.gz
Windows二进制 Gladiatox_1.9.0.zip(32-和64位)
MacOS 10.13(高山脉) Gladiatox_1.9.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gladiatox
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/thgiatox
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/gladiatox/
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