GMICR

doi:10.18129/b9.bioc.gmicr

这是发展GMICR的版本;对于稳定版本,请参阅GMICR

将WGCNA和XCELL读数与贝叶斯网络LEARNing结合在一起,以生成基因模块免疫细胞网络(GMIC)

生物导体版本:开发(3.16)

该软件包使用贝叶斯网络学习来检测WGCNA检测到的基因模块与XCELL定义的免疫细胞特征之间的关系。这是一种假设生成工具。

作者:Richard Virgen-Slane

维护者:gmail.com>

引用(从r内,输入引用(“ GMICR”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ gmicr”)的用法

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ gmicr”)

html R脚本 gmicr_vignette
PDF 参考手册
文本 执照

细节

生物浏览 贝叶斯,,,,聚类,,,,GUI,,,,基因表达,,,,GraphandNetwork,,,,免疫学,,,,网络,,,,网络引导,,,,QualityControl,,,,软件,,,,系统生物学
版本 1.11.0
在生物导体中 Bioc 3.10(R-3.6)(3年)
执照 GPL-2 +文件执照
要看
进口 AnnotationDbi,,,,,,,,Bnlearn,,,,类别,,,,DT,,,,多帕尔,,,,foreach,,,,Grbase,,,,gseabase,,,,粮食,,,,gostats,,,,org.hs.eg.db,,,,org.mm.eg.db,,,,闪亮的,,,,WGCNA,,,,Data.Table,grdevices,图形,RESHAPE2,统计,utils
链接
建议 尼特,,,,rmarkDown,,,,测试
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 gmicr_1.11.0.tar.gz
Windows二进制 gmicr_1.11.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) gmicr_1.11.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gmicr
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/gmicr
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/gmicr/
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