Hireewas

doi：10.18129/b9.bioc.hireewas

这是发展Hireewas的版本；对于稳定版本，请参阅Hireewas。

在表观基因组范围的关联研究中检测细胞型特异性风险CPG位点

生物导体版本：开发（3.16）

在整个表观基因组的关联研究中，每个样品的测量信号是来自不同细胞类型的甲基化谱的混合物。当前的关联检测方法仅声称胞嘧啶 - 磷酸 - 瓜氨酸（CPG）位点是否与表型相关，但他们无法确定风险CPG位点受表型影响的细胞类型。我们提出了一种可靠的统计方法，即高分辨率（HIR），与现有方法相比，该方法不仅可以实质上提高了汇总水平的关联检测能力，而且还可以检测单个细胞类型的风险CPG位点。“ Hireewas” R包是在R中实施租赁模型。

作者：xiangyu luo

维护者：xiangyu luo

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version ='devel'）biocmanager :: install（“ hireeewas”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Hireewas”）

PDF	R脚本	Hireewas
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	DNAMETHYLATY，，，，差甲基化，，，，特征提取，，，，软件
版本	1.15.0
在生物导体中	Bioc 3.8（R-3.5）（3.5岁）
执照	GPL（> = 2）
要看	R（> = 3.5.0）
进口	Quadprog，，，，GPLOTS，grdevices，统计
链接
建议	生物使用，，，，尼特，，，，生物基因
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	hireewas_1.15.0.tar.gz
Windows二进制	hireewas_1.15.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	hireewas_1.15.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/hireewas
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/hireewas
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/hireewas/
软件包下载报告	下载统计